在权藤今吾（三船敏郎）家里，举行了一场关于民族鞋业的董事会议，讨论关于新鞋的质量问题。权藤发表的意见慷慨激昂，他觉得不应该只顾降低成本提高利润，而忽视了鞋子本身的质量。此番言论显然跟其他人急功近利的理念大相径庭，因此其他人合谋决定罢黜他的董事会职位，由某个听话的傀儡顶替。当晚，权藤司机的儿子突然遭到绑架，绑匪以为他是权藤的儿子，因此向权藤勒索3000万元赎金。面对妻子（香川京子）的劝解，深陷困境的权藤只得被迫就范，结果犯人用障眼法，避开了探长（仲代达矢）的耳目，成功取走现金，丝毫不留痕迹。破财的权藤还要面

广见和一辉还有维斯在追捕人猿亡命徒，激战过后人猿亡命徒打算逃跑，大家追近了深山之中，来到了一座旅馆询问怪人的下落。旅馆主人西园寺铃表示自己一无所知，一辉和广见决定召集旅馆中的所有人一一盘问。目前旅馆员工共有3名：女主人西园寺铃、管家花轮真藏与女仆冰室美砂；而住客共有3名：餐饮店员工蛟岛康夫、自由撰稿人权田原太郎与吉他老师上屋直人。这时警察追田现八郎也赶来旅馆，加入了调查的行列。然而大雨引发山体滑坡，所有人都被困在了旅馆之中，电话信号也断了。就在众人尝试联系外界时，楼上传来惨叫，权田原太郎遇害了。另一边，乔

三年前的一天深夜，某海岛小屋发生了一起密室杀人案。被害人在反锁的屋内被锐物刺穿胸背，所在小屋亦被烧毁。已为警察的草薙俊平（北村一辉 饰）回到母校帝都大学，邀请12年不见的老同学汤川学 （福山雅治 饰）协助破案。汤川学一行来到案发现场附近，一边享受海滩风光一边寻找案件线索。随着杀人案侦破工作的推进，只为还原案件物理原理的汤川学逐步逼近着案件的真相，只是此时的他尚未意识到，人心亦是一门科学。片中亦穿插了一段汤川学与草薙俊平的往事。在海风的吹拂下，草薙俊平向汤川学的学生塩野谷（长泽雅美 饰）讲述了一起令他与年少