彼得帕克在内战后受到了钢铁侠托尼斯塔克的赏识，表面上，彼得进入托尼的公司成为了一名实习生，实际上，他和复仇者联盟的成员们一起接受了各种各样的训练。托尼虽然欣赏彼得的勇敢和正直，却并不认为他目前已经拥有加入复联的实力，他派出了特工哈皮暗中观察，这让十分想证明自己的彼得感到万分焦躁。在对付两个银行劫匪的过程中，彼得发现劫匪们使用的是一种前所未见的新型武器，他孤身一人深入敌后顺藤摸瓜找到了幕后主使秃鹰，让他彼得没有想到的是，秃鹰竟然是他爱慕的女生利兹的父亲。

本片由TV动画《鬼灭之刃》第15话-21话构成。炭治郎，伊之助还有我妻善逸在打败响凯，并得到休整后，《鬼灭之刃》的故事也将进入新的篇章，那就是“那田蜘蛛山篇”。在这一篇章，真正有着十二鬼月实力的角色，也将会出现。

故事发生在第1集结束2年后，彼得·帕克继续过着自己的双重生活，平时是性情温和的大学生，晚上则化身为拥有超能力的英雄蜘蛛侠，可是这两者之间的微妙平衡却越来越难以维系，爱人、朋友和慈爱的阿姨都开始怀疑他的真实身份；同时他还多了个更可怕的敌人——章鱼博士，彼得·帕克必须用尽全力对付这位邪恶魔头的疯狂计划。

蜘蛛侠加入了“神盾”，结识了新伙伴：白虎、新星、神力侠、铁拳，还拥有了自己的盔甲。还有章鱼博士、毒液、绿魔等坏人与他作对。绿魔拥有他的DNA，或者说，绿魔可以算是他创造出来的。